Dziennikarka skończyła filmoznawstwo na Uniwersytecie Łódzkim. Zaczynała jako modelka, a także aktorka. Do jej najbardziej znanych ról należy rola Anity "Żyrafy" Borowskiej w serialu "Zostać miss".
Do telewizji trafiła z castingu - najpierw na chwilę do Wizji Sport, a we wrześniu 2001 roku do TVN 24. Jest jedną z niewielu dziennikarek pracujących w stacji od samego początku. Prowadziła wiele programów, obecnie "Fakty po południu" oraz "Fakty po faktach". Ponadto na antenie TVN co drugi weekend wraz z Grzegorzem Kajdanowiczem prowadzi "Fakty".
Za swój telewizyjny debiut w 2003 roku dosotała Wiktora. W 2009 roku ponownie - jako najlepsza prezenterka telewizyjna.
W 2009 roku Werner otrzymała także TeleKamerę "TeleTygodnia" w kategorii "osobowość - informacje i publicystyka".
Ponadto jest zdobywczynią III miejsca w prestiżowym konkursie Grand Press 2010, który co roku wyłania najlepszych polskich dziennikarzy.
W tym roku Anita Werner wydała swoją pierwszą książkę, którą zatytułowała "Dama Pik". Jest to zbiór rozmów, które przeprowadziła przed laty w TVN 24 w programie o tym samym tytule. Zebrała za nią świetne recenzje.
Najlepszą przyjaciółką Anity Werner jest Martyna Wojciechowska. Dziennikarka zajmowała się m.in. jej malutką córeczką Marysią oraz psem, gdy Wojciechowska wspinała się po najwyższych szczytach świata.
Jest panną. Jej mama już nie żyje. Werner dopiero niedawno wyznała, że od 8 lat opiekuje się ciężko chorym tatą.